跨境电商企业和传统企业的股票交易手续费可能在以下方面存在不同：
1. 交易地点与市场规则：跨境电商企业可能在多个国家或地区上市，不同市场交易规则和手续费标准差异大。比如在美股市场，可能按每股固定金额收费；而A股市场常按交易金额比例收费。传统企业多在本土上市，手续费受本土市场规则约束。
2. 交易货币与汇率因素：跨境电商企业涉及多货币交易，股票交易时要考虑货币兑换成本和汇率波动。用外币交易需支付兑换手续费，兑换时汇率变化也影响成本。传统企业若主要在本土交易，一般不存在这类问题。
3. 交易规模和频率：跨境电商发展快、交易活跃，交易规模和频率高，可能因量大与券商协商争取更低手续费率。传统企业交易活跃度相对低，在手续费谈判上优势小。
4. 信息与服务费用：跨境电商企业的海外交易可能需额外信息和服务，如跨境清算、合规审查等，会产生额外费用。传统企业本土交易此类费用少。

总体而言，二者手续费差异由交易地点、货币、规模等因素决定。企业交易前要详细了解不同市场手续费标准和规定。