监管机构对ETF量化交易的监管重点主要集中在几个方面：一是交易公平性，防止某些投资者利用算法优势进行不公平交易，损害普通投资者利益；二是市场稳定性，避免量化交易引发的过度波动和异常交易行为影响市场正常运行；三是合规风控，确保量化交易策略符合相关法律法规和监管规定，并且有完善的风险控制措施。

为确保ETF量化交易的合规运营，可以采取以下措施：
对于监管机构来说，要完善相关法规，明确量化交易的规则和边界，加强对量化交易策略和算法的审查与备案工作，建立实时监控系统，及时发现和处理异常交易行为。同时，加强对量化交易机构的现场检查和非现场监管，对违规行为进行严厉处罚。
对于量化交易机构而言，要建立健全内部合规制度和风险控制体系，对交易策略进行充分的风险评估和压力测试。加强员工的合规培训，提高合规意识。主动配合监管机构的检查和要求，及时报告重大交易情况和风险状况。此外，行业协会可以发挥自律作用，制定行业规范和标准，引导量化交易机构合规经营。