港股通主要分为沪港通下的港股通和深港通下的港股通。两者区别主要体现在以下方面。

首先是开通券商不同。沪港通下的港股通由上海证券交易所和香港联合交易所允许的券商提供服务；深港通下的港股通由深圳证券交易所和香港联合交易所允许的券商开通。

其次是可投资标的不同。沪港通下的港股通标的多为大型蓝筹股，是在联交所上市且恒生综合大型股指数、恒生综合中型股指数的成份股等；深港通下的港股通除了部分沪港通涵盖的大型股，还包含了一些市值较小的恒生综合小型股指数成份股以及深圳证券交易所和香港联合交易所上市的A+H股公司股票，投资范围更广。

另外，市场特点也有差异。沪港通更多地与国内大型企业相关，受国内大型金融机构和宏观经济政策影响较大；深港通由于包含一些中小企业，股价活跃度和弹性相对可能更大。

但总体而言，两者在交易机制、结算方式、交易时间等方面大致相同，投资者可以根据自身的投资目标、风险偏好和对不同类型股票的判断来选择参与哪种港股通交易。