国债逆回购的手续费是在购买时扣除，开户前找线上客户经理可以协商沟通佣金费率，因为线上客户经理是低佣金开户渠道，通过客户经理开出来的账户不仅佣金比较低，而且还可以免费获得线上客户经理提供的投研报告。

国债逆回购的手续费扣除具体分析如下：

1、手续费扣除时间：国债逆回购的手续费是在投资者进行逆回购交易时，由交易系统自动扣除的。当投资者成功下单完成一笔国债逆回购交易，系统会按交易金额和对应手续费率算出手续费，并从证券账户可用资金中划扣。手续费只在买入时收取一次，到期后本金和利息会自动返回账户，无需再支付额外费用。

2、手续费计算方式：手续费通常按照成交金额的一定比例来收取，这个比例即手续费率。不同期限的国债逆回购品种，其手续费率也不同。一般来说，手续费率在十万分之一至千分之三之间，具体费率根据期限而定。例如，1天期逆回购手续费率为十万分之一，2天期逆回购手续费率为十万分之二，以此类推。手续费计算公式为：手续费=成交金额×手续费率。

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