交易时间不同之处
开盘前时段：港股通交易日9：00-9：30为开市前时段，其中9：00-9：15可输入竞价限价盘申报并可撤单，9：15-9：20不可撤单，9：20-9：22为随机对盘时段，9：22-9：30为暂停时段。A股则是9：15-9：25为集合竞价时间，9：15-9：20可撤单，9：20-9：25不可撤单。
持续交易时段：港股通早市是交易日9：30-12：00，午市是13：00-16：00。A股是上午9：30-11：30，下午13：00-14：57为连续竞价时段。
收市阶段：港股通有收市竞价交易时段，为交易日16：00-16：10（其中16：08-16：10随机收市），半日市为12：00-12：10。A股是14：57-15：00为收盘集合竞价时段。
节假日安排差异对港股通交易的影响
常规休市：A股休市期间一律不提供港股通服务。如元旦、春节、国庆节等内地法定节假日，即使香港市场正常开市，港股通也会暂停交易。
新增交易日：交易日历优化后，在部分内地节假日之前，若内地与香港市场均为交易日，会出现新增港股通交易日。对于新增港股通交易日的交易，交收日为交易当日后第二个港股通交收日（T+2日）。如果港股通证券分拆或合并业务落在内地节假日或节后第一个港股通交易日，则暂停该证券在前述节假日之前新增港股通交易日的交易。