基金手续费相关纠纷的常见原因主要包括以下几点：

信息不对称：投资者在购买基金时，可能没有充分了解基金的交易规则、手续费计算方式等信息。这种信息的不对称可能导致投资者在后续赎回或其他操作时产生误解，从而引发纠纷。

提示不明确：基金公司或代销机构在销售基金的过程中，关于手续费的提示可能不够明显或详细。投资者未能及时获知交易费率的相关信息，可能会在实际交易时产生意外费用，引起不满和纠纷。

合同条款争议：涉及基金购买、赎回、管理费用等方面的合同条款可能存在理解上的差异或履行上的争议。例如，某些条款的解释不一致，或者实际操作与合同条款不符，这些都可能引发手续费相关的纠纷。

通过以上分析，可以看出基金手续费相关纠纷主要由信息不对称、提示不明确和合同条款争议等问题引发。投资者在购买基金时应仔细阅读相关合同条款，并积极了解手续费的计算和收取方式，以减少纠纷的发生。基金公司和代销机构也应在销售过程中提供更加明确和详细的信息提示，帮助投资者做出更明智的决策。