港股通投资者的权益登记日与A股的权益登记日确定方式确实不相同。具体差异如下：

港股市场：

交收制度：港股市场实行T+2交收制度，即交易后的第二个交易日完成交收。权益登记日：通常是在分红派息的前几个交易日，且除净日（Ex-Dividend Date）必须在股权登记日（Record Date）之前。投资者需要在权益登记日之前持有股票，才能享有分红派息的权利。

A股市场：

交收制度：A股市场实行T+1交收制度，即交易当天完成交收，但资金在T+1日方可取出。权益登记日：通常是在分红派息的前一个交易日收盘后进行统计。其除权除息日（Ex-Dividend Date）通常是在股权登记日后的一个交易日。投资者需要在权益登记日收盘时持有股票，才能享有分红派息的权利。

因此，投资者在投资港股通时，需要特别注意港股市场的交易规则和时间安排，与A股市场的权益登记日制度进行区分，以便准确把握相关权益的获得时机。