新三板基础层和创新层的交易门槛存在一定差异，主要体现在投资者准入条件方面。根据全国股转系统的相关规定，基础层对自然人投资者的要求相对较高，申请开通交易权限前10个交易日日均金融资产需达到200万元以上，同时具备2年以上证券、基金、期货投资经历。而创新层的门槛则适当降低，要求自然人投资者前10个交易日日均金融资产不低于100万元，同样需要2年以上投资经验。对于机构投资者，基础层和创新层都要求其净资产不低于500万元。这种差异化安排主要是考虑到创新层企业整体质量相对较好，风险程度适中，因此适当降低了投资者门槛。此外，两个层级的交易方式也有所不同，创新层实施集中竞价交易，而基础层主要采用集合竞价交易。

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