在网上申请证券公司低手续费账户，可按以下步骤进行：

首先，做好前期准备。通过财经网站、投资论坛、朋友推荐等途径，了解不同证券公司的手续费标准、服务质量、口碑评价等信息，筛选出几家手续费相对较低且综合实力较强的公司。

然后，进入证券公司官网或下载官方APP。在官网首页一般有开户入口，APP上也会有明显的开户指引。点击开户后，按提示上传本人清晰的身份证正反面照片，系统会自动识别信息，要仔细核对确保无误。

接着，进行视频认证。与证券公司工作人员视频连线，回答一些身份确认问题，比如是否本人开户等，以确认是本人操作。

完成上述步骤后，绑定银行卡。选择一家自己常用的银行卡，按照系统提示输入卡号等信息，完成绑定。

在设置交易密码和资金密码时，要设置强度较高、容易记但不易被他人猜到的密码。

最后，风险测评环节如实填写相关信息，证券公司会根据测评结果为你提供适合的投资产品和服务。

申请时可与客服沟通，表明自己对低手续费的需求，尝试申请更优惠的费率。开户成功后，交易前要确认手续费是否符合预期。