市场风险：ETF 指数基金跟踪特定的指数，其净值会随着标的指数的波动而变化。如果市场整体下跌，标的指数也会下跌，从而导致 ETF 基金的净值下降，投资者可能会遭受损失。例如，在经济衰退、政策调整或全球市场动荡等情况下，股票市场整体表现不佳，跟踪股票指数的 ETF 基金也难以独善其身。
跟踪误差风险：尽管 ETF 基金旨在紧密跟踪标的指数，但由于各种因素，如成分股分红、成分股调整、基金管理费用、交易成本等，可能会导致基金的净值与标的指数的走势存在一定的偏离，即跟踪误差。如果跟踪误差较大，可能会影响投资者的收益，无法完全实现与指数相同的投资回报。
流动性风险：一般来说，大多数 ETF 基金具有较好的流动性，但对于一些跟踪小众指数或交易不活跃市场的 ETF，可能会面临较低的交易量和买卖价差较大的问题。在这种情况下，投资者在买卖 ETF 份额时可能会遇到困难，或者需要以较不利的价格成交，尤其是在大额交易时，可能会对投资收益产生较大影响。
行业集中风险：一些 ETF 基金可能会集中投资于某个特定的行业或板块，如科技 ETF、金融 ETF 等。如果该行业受到不利因素影响，如政策调整、技术变革、市场竞争加剧等，那么该 ETF 基金的净值可能会受到较大冲击。例如，当政府对某一行业加强监管时，该行业的企业股价可能会下跌，进而导致相关 ETF 基金的净值下跌。
利率风险：对于跟踪债券指数的 ETF 基金，利率的变动是一个重要风险因素。当市场利率上升时，债券价格通常会下跌，导致债券 ETF 的净值也可能下降。这是因为新发行的债券会提供更高的收益率，使得现有债券的吸引力下降，从而价格下跌。
政策风险：政府的宏观经济政策、行业政策等对 ETF 基金的投资标的可能产生重大影响。例如，税收政策的变化、对某些行业的扶持或限制政策等，都可能改变相关企业的经营环境和盈利能力，进而影响 ETF 基金的投资价值。
汇率风险：如果 ETF 基金投资于海外市场或包含一定比例的外币资产，那么汇率波动就会对基金的净值产生影响。当本国货币升值时，海外资产的价值换算成本国货币后可能会下降，反之亦然。例如，投资于美国股市的 ETF 基金，当人民币兑美元汇率上升时，即使美国股市没有变化，该 ETF 基金以人民币计价的净值也可能会下降。