在手机上申请证券低手续费账户的步骤如下：

准备材料：确保你有智能手机、有效身份证件（如身份证）和银行卡。

选择券商：挑选一家信誉良好、手续费较低且服务优质的证券公司。可以通过查看用户评价和比较不同券商的费用来选择。

下载APP：在手机上下载所选券商的官方APP。通常可以在应用商店（如App Store或Google Play）中找到。

注册并填写信息：打开券商APP，按照提示进行注册，填写个人信息，包括姓名、身份证号码、联系方式等。

上传身份证照片：根据APP的指示，拍摄并上传你的身份证正反面照片。

绑定银行卡：输入并绑定你的银行卡信息，用于资金的出入。

视频认证：部分券商可能要求进行视频认证，以确认你的身份。按照指示完成视频认证即可。

协商佣金：在开户过程中或开户后，可以联系券商的客户经理，说明你的资金量和交易频率，尝试协商调整佣金至更低水平。

完成开户：提交所有信息后，等待券商审核。审核通过后，你将收到通知，账户正式开通。

完成以上步骤后，你就可以获得一个低手续费的证券账户了。