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国债逆回购的手续费是按照成交金额的一定比例来收取的，这个比例通常很低，一般在0.001%至0.03%之间。具体来说，手续费的费率会根据国债逆回购的期限不同而有所差异。例如，1天期的国债逆回购手续费率为0.001%，即每10万元交易金额收取1元手续费；2天期为0.002%，3天期为0.003%，以此类推，7天期为0.005%，14天期为0.01%，28天期为0.02%，而28天以上的国债逆回购手续费率则为0.03%。

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