小资金申请证券公司低手续费，可以采取以下几种方法：

比较券商佣金费率：不同证券公司的佣金费率可能存在差异，选择费率较低的券商可以有效降低交易成本。可以通过互联网、券商官方网站或相关财经网站进行比较。

联系线上客户经理：通过证券公司的官方渠道（如官方网站、APP、客服电话等）找到线上客户经理，表达自己希望开设低手续费账户的需求。有时客户经理可以提供一定的佣金优惠。

关注开户优惠活动：许多证券公司会不定期推出开户优惠活动，佣金打折等。留意这些活动信息，并在活动期间进行开户，可以享受更低的手续费。

参与社区团购或投资者群体：有些投资者社区或群体会与证券公司合作，提供团购优惠。加入这些群体后，可能可以通过集体力量获得更低的佣金费率。

多次协商：如果是长期投资者，可以多次与客户经理协商，展示自己的投资计划和资金量，有时可以获得更低的佣金费率。

在准备开户时，需要准备好身份证和银行卡，并在客户经理的指导下完成相关手续，同时协商好具体的佣金费率。