基金的手续费扣除时间因费用类型和基金公司的规定而异。一般来说，主要的费用有以下几种：

申购费：这是投资者在购买基金时需要支付的费用，通常在申购时直接扣除。也就是说，您在申购基金时，申购费会从您的投资金额中扣除。

赎回费：这是投资者在卖出基金时需要支付的费用，通常在赎回时扣除。赎回费的费率可能会依据持有时间的长短而有所不同，持有时间越长，赎回费率可能越低。

管理费和托管费：这些费用是基金运作过程中产生的费用，通常是每日从基金资产中计提，每月支付。这类费用不会单独向投资者收取，而是直接从基金的资产中扣除。

销售服务费：有些基金还会收取销售服务费，这些费用也是从基金资产中每日计提。

总结来说，基金手续费的扣除时间因费用类型的不同而不同。申购费在申购时扣除，赎回费在赎回时扣除，而管理费、托管费和销售服务费是在基金运作过程中从基金资产中每日计提并支付。投资者在进行基金投资时应详细阅读基金的招募说明书和相关费用说明，以了解具体的费用结构和扣除方式。