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南京地区比较好的证券公司降低佣金方法如下：

1.积极沟通与协商：与所选择的证券公司的客户经理进行深入沟通，表达希望降低佣金的意愿。客户经理为了争取业务，通常会愿意提供更优惠的佣金费率。

2.选择合适的券商：市场上不同证券公司的佣金费率差异较大，通过比较和选择佣金较低的券商，可以有效降低交易成本。同时，也可以考虑选择规模稍小的证券公司，这类公司为了抢占市场，所设置的佣金限制可能会相对宽松，佣金也更容易商量。

3.利用资金或交易量优势：如果拥有大额资金或频繁交易，可以成为与证券公司谈判降低佣金的重要筹码。证券公司通常会根据投资者的交易活跃度或账户总资产来调整佣金率。

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