针对“昨天好好的科大智能三千股，今天检查突然变成0，而总持仓金额不变”的情况，可能的原因分析如下：

股票停牌或退市：若科大智能因重大事件停牌或退市，账户中该股票数量可能显示为0，但总持仓金额不变。建议查看公司公告或咨询券商了解具体情况。
账户显示错误：券商交易系统可能出现故障，导致股票数量显示错误。可尝试刷新页面或重新登录，若问题依旧，及时联系券商客服解决。
股票转托管：若进行了股票转托管操作，股票会从原账户转移到新账户，导致原账户股票数量变为0。确认是否进行了转托管操作。
股票被卖出：在不知情的情况下，可能误操作卖出了科大智能股票。查看交易记录，确认是否有卖出操作。
其他异常情况：如账户被盗用或券商系统数据错误等。立即联系券商客服，核实账户情况，确保资金安全。
总之，遇到这种情况不必慌张，通过仔细排查和与券商沟通，通常可以找到原因并解决。同时，建议定期检查账户交易记录，确保账户安全。