国债逆回购是一种短期贷款性质的投资工具，投资者将资金借给其他金融机构，并在到期时收回本金和利息。对于投资金额为1000元的国债逆回购，其交易费用（手续费）计算方式如下：

手续费计算：国债逆回购的手续费按成交金额的十万分之一来收取。具体来说，如果成交金额为1000元，手续费为1000元 × 0.0001 = 0.01元。

不同期限的手续费率：国债逆回购有不同的期限，常见的有1天期、7天期、14天期等。虽然手续费率通常为十万分之一，但不同期限可能会有细微差异。例如，1天期的手续费率可能为0.001%（十万分之一），而7天期的可能为0.005%（十万分之五）。

自动返还：手续费只在买入时一次性收取，到期后本金和利息会自动返回到投资者的账户，无需手动操作赎回。

总的来说，投资国债逆回购的手续费非常低，对于小额投资如1000元，手续费仅为0.01元，几乎可以忽略不计。然而，具体的手续费率和计算方式可能会因券商或市场情况有所不同，建议投资者在交易前咨询相关券商以获取最新的费率信息。