申请低佣金的证券账户可以按照以下步骤进行：

了解佣金结构：首先要了解证券账户的佣金结构，包括佣金和规费。确认佣金是否包含规费，避免被误导。

避免官网或App直接开户：不要直接在券商的官网或App上开户，因为这样通常会得到默认的较高佣金（例如万3佣金）。通过其他渠道可能更容易获得低佣金。

联系客户经理：通过券商的客户经理或代理进行开户。客户经理通常有更大的权限可以为你调整佣金率。在开户前，明确表示希望获得低佣金，并确认具体的佣金包含规费的情况。

选择合适的券商：大券商通常佣金较高，因为有品牌优势；中小券商为了吸引客户，通常愿意提供更低的佣金。可以选择信誉良好的中小券商来开户。

签订第三方存管协议：开户时会签订第三方存管协议，账户资金由银行管理，确保资金安全。

比较不同券商的优惠：在决定之前，多比较几家券商的优惠政策，选择最适合自己的。

通过这些步骤，你可以更容易地申请到低佣金的证券账户。