你好，一是股票的发行方式不同。新三板实行的是准注册制，上市之初对挂牌企业的行业并没有明确限制，相当于是注册制的“先行者”和“试验田”。而这次科创板将要试行注册制，是中国资本市场基础制度改革创新的“试验田”，将开辟出一条创新性的路径。
　　二是参与主体投资者不同。投资科创板的门槛是50万资产+2年交易经验，相比于新三板的500万门槛低了很多，所以说科创板的参与主体范围更大，活跃度更强。
　　三是交易方式不同。新三板采用的是做市转让和协议转让，相当于场外交易市场，而科创板则设立在上交所，和主板、中小板一样，是一个场内交易的股票板块，相当于上交所的“创业板”。二者的流动性不可同日而语，科创板将会更好的解决中小型科技创新型企业的融资问题。
而科创板和创业板虽然有一些交集，都带一个“创”字，但其实有着很多不同。
　　首先，上市公司的类型不同。科创板的“创”，代表的创新，因此科创板针对的行业是医药、半导体、高端制造等高精尖行业。科创板重点针对技术上处于市场顶尖，突出的是“科技”和“创新”的概念。创业板的“创”指的是创业，是为暂时无法在主板上市的创业型、中小科技企业提供融资途径和成长空间的证券交易市场，是对主板市场的重要补充。创业板企业可以视为主板和中小板的“后备军”。
　　其次，是上市制度的不同。虽然创业板相对于主板和中小板有了一些改革和创新，比如说：没有ST股票，三年亏损就暂停上市，对投资者有经验要求等等。但是依旧延续着主板同股同权、核准制、注重企业盈利能力和规模等等一些要求。科创板在吸纳创业板优秀经验的基础上，进一步创新了很多制度设计，比如说，进一步放宽入市门槛，实行最严格监管和退市，放宽涨跌幅限制，对投资者的要求也更为严格等等。科创板在制度设计上可以简单理解为是创业板的改革升级版。
你可以参考一下哦，祝你投资顺利