通过同花顺开东莞证券的股票账户确实有一定的便利性，但也存在一些可能的缺点：

佣金费率较高：通过第三方平台如同花顺开户，佣金可能会高于直接在东莞证券开户的费用。建议在开户前详细了解并比较不同渠道的佣金费率。

服务限制：通过同花顺开户，可能无法享受到东莞证券提供的全部服务和优惠活动。某些专属服务或活动可能仅限于直接在东莞证券开户的客户。

信息安全：虽说同花顺是一个比较成熟的平台，但通过第三方平台提供个人信息总归存在一定的安全隐患。确保在开户过程中保护好个人信息。

客户服务响应：在通过同花顺开户后，遇到问题时可能需要通过同花顺的客服进行沟通，而不是直接联系东莞证券的客服，这可能会影响问题解决的效率。

账户管理复杂：如果你在多个平台开立了多个证券账户，管理和操作上可能会变得较为复杂，不利于集中管理资金和投资策略。

在决定通过同花顺开东莞证券账户之前，建议充分权衡这些可能的缺点，并根据自身需求做出最适合的选择。