您好，很高兴为您解答问题。在支付宝开证券账户本身是不会扣钱的，也就是说，开户这一行为是免费的。支付宝作为一个第三方支付平台，与多家证券公司合作，为用户提供了便捷的证券交易服务。用户可以通过支付宝APP开设证券账户，这个过程中不会产生任何开户费用。

虽然开户免费，但在进行股票交易时，会涉及到佣金费用。证券公司会根据用户的交易金额收取一定比例的佣金，作为提供交易服务的费用。佣金费率的具体数值可能因证券公司和用户的具体协商情况而异，但一般来说，直接通过支付宝开设的证券账户，其默认佣金费率在万分之三左右，且每笔交易还需收取至少5元的佣金。如果用户希望在交易时降低成本，可以在开户前与证券公司的客户经理进行沟通，协商降低佣金费率。

此外，除了佣金之外，股票交易还可能涉及其他费用，如印花税和过户费。印花税是卖出单边收取的，税率为成交金额的万分之五（0.05%），而过户费则是按照成交金额的万分之0.1（0.001%）双向收取的。

温馨提示：在支付宝开证券账户本身不会扣钱，但进行股票交易时会产生佣金等费用。用户在开户前可以了解相关费用情况，并与证券公司协商以降低交易成本。

以上便是对在支付宝开证券账户是否会扣钱的解答，如想要办理低佣金账户可以联系我（加我微信即可），国内前十知名券商竭诚为您服务,十年从业经验让您投资少走弯路，找我开户就是省钱！