两融交易的手续费主要由以下几部分构成：
佣金：计算方式：按照单笔交易金额 × 佣金费率来计算收取。多数证券公司两融账户的佣金费率与普通账户相差不大，不过可能会比普通账户的佣金费率高 0.1‰左右。目前市场上一般默认的两融佣金费率在万分之三左右，但实际上是可以与客户经理协商调整的。

收费标准：如果按照上述计算方法得出的佣金金额不足 5 元，那么证券公司会按照 5 元的标准进行收取。

印花税：计算方式：只在股票卖出时收取，按照交易金额的万分之五来计算。

利息：融资利息：融资利息 = 融资金额 × 融资利率（年利率）× 实际融资天数 / 360。目前市场上开通两融账户后默认的融资利率是 8.35% 左右，但也是可以与证券公司协商调整的。融券费用：融券费用 = 融券卖出价格 × 融券数量 × 融券费率（年费率）× 实际融券天数 / 360。融券的费率通常会比融资的利率略高一些。
举个例子，如果您融资买入了 10 万元的股票，融资利率为 6%，持有了 30 天，那么融资利息 = 100000×6%×30/360 = 500 元；如果您卖出了价值 5 万元的股票，那么印花税 = 50000×0.1% = 50 元。同时，如果您的这笔交易产生的佣金按照万分之三计算，且超过了 5 元的最低收费标准，那么佣金 = 100000×0.03% = 30 元。所以这笔交易的总手续费就是融资利息 500 元、印花税 25 元、佣金 30 元。