区别一:跟投机制
　　科创板注册制要求券商对其保荐的所有项目进行强制跟投。
　　创业板注册制不再要求券商对其保荐的所有项目进行强制跟投，而是仅对未盈利，红筹架构，特殊投票权以及高价发行的四类公司采取强制性跟投。
　区别二:盈利要求
　　科创板科创板围绕“市值”为核心设置了五套上市标准，另对红筹企业和特殊股权结构企业的上市制度做明确规定。其中，第五套标准允许未盈利企业上市。
　　创业板改革后设置了三套上市标准，一是完善盈利上市标准，要求“最近两年净利润均为正且累计净利润不低于5000万元”或者“预计市值不低于10亿元，最近一年净利润为正且营业收入不低于1亿元”。二是取消最近一期末不存在未弥补亏损的要求。三是支持已盈利且具有一定规模的特殊股权结构企业、红筹企业上市。四是明确未盈利企业上市标准，但一年内暂不实施，一年后再做评估。
区别三:投资者适当性要求
　　创业板注册制新增创业板个人投资者拟须满足前20个交易日日均资产不低于10万元等门槛，参与证券交易24个月以上，存量客户不受影响。
　　科创板对个人投资者开户设立了50万的资产和2年证券交易经验的门槛。
区别四:退市制度
　　科创板首次引入市值标准，对于连续20个交易日市值低于3亿元的上市公司进行强制退市。
　　创业板新增“连续20个交易日市值低于5亿元”的退市指标。
区别五:错位发展
　　证监会表示，创业板和科创板都承担着资本市场服务创新发展和经济高质量发展的战略任务，两个板块各具特色、错位发展。科创板面向世界科技前沿、面向经济主战场、面向国家重大需求，主要服务于符合国家战略、突破关键核心技术、市场认可度高的科技创新企业。创业板主要服务成长型创新创业企业，支持传统产业与新技术、新产业、新业态、新模式深度融合。
（以上仅为参考）