一、两者服务的对象不同。老三板最早承接的是两网公司和退市公司，这些都是公众公司，新三板成立之初服务的对象主要是中小微型企业（当然，现在离中小微企业距离比较遥远了，所以国家后来成立了新四板），这些企业都是非上市公司，当然也不是公众公司。

二、两者的企业挂牌条件也不同。在老三板挂牌的企业，在挂牌前都需要经过一系列合法的公开程序，与此同时还得具有我国相关的证券发行资质。在新三板挂牌的企业，挂牌前不需要公开程序，也不需要具有证券发行资质，只要满足新三板挂牌条件就可以了。

三、新三板和老三板发行的股票也不相同。老三板发行的股票，是以400开头或者420开头的六位交易代码股票，新三板发行的股票，是以430开头的六位交易代码股票。老三板的股票是因为连续的困损而从沪深交易市场退市或者直接就没有在沪深交易市场上市的股票。新三板发行的股票是直接在三板市场上市由中关村科技园发行的股票。

四、两者的功能定位不同。老三板是企业股权交易的平台。而新三板不但能够进行股权转让而且还是一个很好的融资平台