港股通和A股交易所在手续费上存在一些不同之处。以下是一些主要区别：

交易佣金：在A股市场中，佣金费用通常是按照成交金额的一定比例收取的。而在港股通中，佣金费用通常是按照成交金额的一定比例收取，但也可能会有最低佣金的设定。

交易征费：在A股市场中，交易征费是指中国证券监督管理委员会（CSRC）收取的交易费用。在港股通中，交易征费是指香港证券及期货事务监察委员会（SFC）收取的交易费用。这两个机构对交易征费的收取标准可能会有所不同。

印花税：在A股市场中，印花税是指购买和卖出股票时需要支付的印花税费用。在港股通中，香港政府收取印花税。

结算费用：在A股市场中，结算费用是指证券公司为客户办理交易结算所收取的费用。在港股通中，结算费用也会有所不同，具体取决于证券公司的政策。

需要注意的是，以上所列费用仅供参考，实际的费用可能会因为不同的证券公司和交易所政策而有所变化。投资者在选择投资港股通或A股交易所时，应该仔细了解相关费用，并与自己的证券公司进行详细咨询。