债券指数基金和债券基金在多个方面存在显著的区别，以下将分点表示和归纳这些区别：

投资方式和策略：债券基金：主要投资于债券，包括国债、企业债、金融债等。其投资策略多样，涵盖利率风险管理、信用风险管理和流动性管理等方面，可以根据基金经理的判断和市场环境进行调整。债券指数基金：则专注于跟踪债券市场指数，旨在复制债券市场的整体表现。其投资策略主要通过购买与特定债券指数成分券相匹配的债券，采用完全复制或抽样复制的方法，力求跟踪债券指数的表现。风险水平：债券基金：由于投资策略的多样性和灵活性，其风险水平可能因市场环境、基金经理的决策等多种因素而有所不同。债券指数基金：由于采取的是盯住目标债券指数分散投资的方法，在个券变动上比较灵活，有效地降低了个券下跌对整个投资组合的影响，将风险减到最低。因此，其风险通常低于传统债券基金，仅比货币市场基金要高一些。管理成本与交易费用：债券基金：管理成本和交易费用因基金公司和投资策略的不同而有所差异。债券指数基金：费用与传统债券基金相比有较大的优势。由于指数债券基金往往采取的是自上而下的选券路径，按指数的构成买入债券并持有，在必要的时候对投资组合进行微调，管理成本较低，从而降低了基金费用。根据美国市场统计，指数债券基金平均费用只有0.35%，而非指数债券基金的平均费用在0.96%。收益表现：债券基金：收益表现受市场环境、基金经理的投资决策等多种因素影响，具有较大的不确定性。债券指数基金：其稳定收益符合那些长期追求与市场相似收益率的投资者的偏好。大量事实证明，债券指数基金往往能够获得与市场相近或略高的收益。例如，根据晨星相关资料，在1988年到1998年十年间，债券指数型基金的平均年收益率为8.9%，而积极管理下的传统债券基金的年收益率为8.2%。投资门槛：债券基金和债券指数基金：作为公募基金，其投资门槛都相对较低，适合各类投资者。

综上所述，债券指数基金和债券基金在投资方式、风险水平、管理成本与交易费用、收益表现等方面存在明显的区别。投资者在选择时，应根据自身的投资目标、风险承受能力和市场环境等因素进行综合考虑。