方正证券的股票交易佣金收费标准和方式如下：

1. 佣金计算方式：
- 主要采用净佣金模式，即成交金额乘以佣金比率。
- 佣金比率根据交易金额的不同而有所差异。一般来说，交易额在5万以下，按照万分之五（0.05%）的比例收取；交易额在5万以上至100万以下，佣金比率逐渐降低，最低可至万分之三（0.03%）。交易额超过100万的部分，佣金比率进一步降低至万分之二点五（0.025%）。

2. 其他费用：
- 除了佣金外，还包括规费（包含证管费和经手费，按成交金额的0.0541‰双向收取）、过户费（双边收取，按实际成交金额的千分之0.01计算）和印花税（仅对卖出行为征收，按交易额的万分之五计算）。

3. 最低佣金标准：
- 对于交易额较小的交易，方正证券设置了最低佣金标准，一般为5元。如果按佣金比率计算出的佣金金额低于5元，将按5元收取。

总之，方正证券的股票交易佣金收费标准和方式相对灵活，并根据交易额的大小进行了阶梯式设置。

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