1、时间不同
基金认购：是在开放式基金募集期、基金尚未成立时购买基金份额。
基金申购：是在基金成立之后购买基金份额。
2、价格不同
基金认购：购买价格是基金单位价格，一般为1元/单位；
基金申购：购买价格是当日基金单位净值，不一定为1元。遵循的是“未知价”原则，即申购价格按照当日收市后计算的基金份额净值为基准进行计算(每日按照面值进行报价的货币基金除外)
3、赎回条件不同
一只普通的开放式基金的诞生，会经历三个阶段：募集期、封闭期、存续期
1、募集期：基金份额发售之日到基金成立为止，按规定不能超过三个月。具体以基金公司公告为准。
2、封闭期：为实现基金平稳运行，在基金合同生效后设立的一个特殊时段，期间投资者不能申购和赎回基金份额。按规定不超过三个月，具体以基金公司公告为准。
3、存续期：封闭期后打开后，基金进入日常交易期。此时开放正常申购和赎回。
4、费率可能不同：
目前基金公司通常会设定不同档次的认购和申购费率，即根据投资者购买金额的多少适用不同水平的费率。在同一购买金额下，认购费率和申购费率也可能有所不同，具体情况需查询各基金费率情况说明。