炒股手续费和ETF基金佣金的主要区别在于它们的收费主体、收费方式和收费标准。

1.收费主体

炒股手续费是由券商收取的，包括佣金、印花税、过户费等。而ETF基金佣金则是由基金公司收取的，与证券公司关系不大。

2.收费方式

炒股手续费通常包括佣金、印花税、过户费等多个部分，其中佣金是最主要的费用，根据券商不同有所区别，最低是万1，有的是万2，或者万2.5，万3，但是单笔交易最低收取5元，不足5元按5元计算3。而ETF基金佣金则相对简单，一般按沪深交易所佣金标准收取。

3.收费标准

炒股手续费的标准因券商而异，具体取决于投资者的交易量和资产规模等因素。而ETF基金佣金的标准则主要由基金公司决定，各个基金产品的收费可能会有所不同。

总的来说，炒股手续费和ETF基金佣金虽然都是为了完成交易所需支付的费用，但它们的具体规定和收取方式存在一定的差异。在选择投资方式时，投资者应充分了解并比较各种费用，以做出最适合自己的决策。