科创板上市公司连续三年亏损会被暂停上市，但并不会直接退市。

根据《科创板股票发行与交易管理办法》规定，在科创板上市公司连续两个会计年度内出现亏损时，证监会将要求其说明原因，并在该信息公开后30个自然日内进行重组或者其他解决方案。如果公司第三年继续亏损，那么从公布第三年年度报告之日起，其对应的证券交易所会对其股票实施停牌操作，即暂停上市。

然而，如果暂停上市的公司在宽限期内能够扭亏为盈，那么可以在公司年度报告公布之后，向中国证监会提出恢复上市的申请。

因此，虽然科创板上市公司连续三年亏损会被暂停上市，但仍有可能通过重组或其他方式实现盈利并恢复上市。直接退市的情况相对较少，通常是在公司无法扭转亏损或存在其他严重问题的情况下才会发生。