理财产品的持有份额少于本金，可能是由以下原因造成的：

1. 净值不是1：理财产品的成本=理财产品的份额净值*份额。如果某款理财产品的份额净值高于1元，那么投资者持有理财产品的份额就会少于本金。
2. 手续费、交易费用和税费：在进行买卖交易时，投资者通常需要支付一定的交易费用，这包括佣金、印花税等。这些费用会减少实际投资的金额，从而使份额少于本金。另外，如果投资收益需要缴纳资本利得税或股息税，这也会减少最终的投资回报，导致持有的份额少于本金。
3. 管理费用：如果投资者选择投资于基金或受托管理的投资组合，他们通常需要支付管理费用。这些费用是根据管理资产的百分比计算的，会定期扣除，从而降低了投资的价值。
4. 投资损失：投资市场波动是不可避免的，有时投资可能会亏损。如果投资表现不佳，投资者可能会看到其投资本金减少，从而导致持有的份额少于本金。
5. 分红和利润再投资：如果投资者选择将分红和利润再投资到原始投资中，他们可能会看到持有的份额增加。但如果选择将这些资金提取出来，那么持有的份额就会少于最初的本金。

需要注意的是，理财产品的净值在一定的时间内可能发生变动，从而影响持有份额的价值。因此，投资者在购买理财产品时应该充分了解产品的特点和风险，根据自身需求和风险承受能力做出投资决策。同时，也需要注意操作过程中的风险和问题，以便更好地保护自己的利益。