第一，灵活，公募基金对同种股票有着10%的投资比例限制，然而私募证券投资基金不受限制或者限制较少，一旦私募证券投资基金发现了一个价值被低估的股票，他们可以尽可能多的去买这只股票；私募基金还可以做公募基金不能操作的金融衍生品和一些跨市场的套利。另外，私募基金规模一般小于公募基金，有利于资金进出和调整。
第二，激励机制。公募基金费用有管理费、申购费和赎回费（托管费归银行）。而私募证券投资基金的利润来源主要是业绩收益的分配，而不是管理费，给客户创造盈利越多，他们的收入越多，这也促使了基金管理者会想方设法地提高基金的收益率。
第三，收益参照。私募做的是绝对收益，而公募基金还要考虑每季度、半年以及年终的排名，对基金经理会产生很大的压力。私募基金的业绩参照标准是每年的绝对收益，而公募基金的参照标准是大盘指数。私募基金相对来讲更容易实现长期稳定的业绩增长。
第四，发行方式，公募基金公开发行，私募基金在私下里对特定对象募集。公募基金定期信息披露，比私募基金更加透明。公募基金集合理财的方式，面向普通大众，私募基金门槛较高，风险也高于公募基金。