想要申请证券公司账户开户费率最低的账户，可以采取以下几种方法降低费率：

选择规模大、信誉好的证券公司：规模大、信誉好的证券公司由于其资金实力雄厚，往往能够提供更低的佣金费率。同时，这些证券公司的交易系统也相对稳定，能够保证交易的顺利进行。

直接与证券公司的客户经理协商：投资者可以事先联系证券公司的客户经理，与其协商低佣金费率。客户经理可以根据投资者的资金量和交易量等情况提供相应的低佣金方案。

开通VIP账户：一些证券公司会为高净值客户提供VIP账户服务，这种账户的佣金费率通常较低。投资者可以向证券公司的客户经理咨询VIP账户的开通条件和流程。

参与证券公司的优惠活动：证券公司有时会推出优惠活动，如新开户降低佣金费率等。投资者可以关注证券公司的官方网站或客服电话，了解最新的优惠活动。

选择互联网证券公司：一些互联网证券公司为了吸引客户，会推出更低的佣金费率。投资者可以通过比较不同互联网证券公司的佣金费率和服务质量来选择适合自己的平台。

需要注意的是，不同的证券公司和不同的开户方式可能存在不同的佣金费率和优惠条件。投资者在选择开户方式和协商低佣金费率时，需要仔细了解不同产品和服务的佣金费率、交易费用、服务质量等方面的差异，以便做出明智的选择。同时，也需要注意开户流程的安全性和规范性，选择可靠的渠道进行开户操作。