收益情况不同基金、股票：收益是不确定的;债券：的收益是确定的;一般情况下，基金收益比债券高，我们生活中大都数人买的基金与股票、债券，证券投资基金是一种间接的证券投资方式，基金的投资者不再直接参与有价证券的买卖活动，不再直接承担投资风险，而是由专家具体负责投资方向的确定、投资对象的选择。
价格取向不同在宏观政治、经济环境一致的情况下，基金的价格主要决定于资产净值;而影响债券价格的主要因素是利率;股票的价格则受供求关系的影响巨大。
投资回收方式不同1、债券投资是有一定期限的，期满后收回本金;2、股票投资是无限期的;3、投资基金则要视所持有的基金形态不同而有区别：封闭型基金有一定的期限，期满后，投资者可按持有的份额分得相应的剩余资产，在封闭期内还可以在交易市场上变现。
虽然几种投资工具有以上的不同，但彼此间也存在不少联系：基金、股票、债券都是有价证券，对它们的投资均为证券投资。基金份额的划分类似于股票：股票是按“股”划分，计算其总资产;基金资产则划分为若干个“基金单位”，投资者按持有基金单位的份额分享基金的增值收益，契约型封闭基金与债券情况相似，在契约期满后一次收回投资。另外，股票、债券是证券投资基金的投资对象，在国外有专门以股票、债券为投资对象的股票基金和债券基金。