（1）交易方式上，ETF与股票交易相同，无杠杆效应，而股指期货则是保证金交易，具有一定的杠杆效应；保证金交易在头寸建立的过程中若股票指数的行情走势与预期相反，将会面临保证金追缴的问题，ETF则无保证金的压力，无需担心短线上保证金追缴的压力，更能慎重地选择出场时机。
（2）股指期货面临着一定的基差风险，即股指期货与其标的现货的价差是可能在一定的区间内波动的。随着投资者对大盘的预期不同，股指期货走势不一定和指数完全一致，可能有一定范围的折价或溢价，折溢价程度取决于套利的资金量和套利的效率；而ETF则是密切跟踪标的指数，其净值的变化通常与标的指数的变化保持较高的一致性。
（3）最低交易金额不同。每张股指期货合约的最低保证金至少在万元以上，而ETF的最小交易单位为1手，对应的最低交易金额较少。
（4）买卖股指期货没有包含标的指数成份股的红利，而持有ETF，标的指数成份股的红利归投资者所有。
（5）持有期上，ETF可以长期持有，但股指期货会有交割日问题，到期日如还需跟踪指数，则需要重新买入新的股指期货合约。