期货交易之间存在的风险有基差风险，跟踪误差风险，强行平仓风险，冲击成本风险
1、基差风险
基差是指现货价格与期货价格间的价差，因此基差的变动反映了现货价格和期货价格的相对走势。基差的变动会对套期保值的效果产生一定影响，通常称之为基差风险。
2、跟踪误差风险
构建的股票组合通常不能完全同指数构成相匹配。套利者正向套利时，如遇到某权重股涨停或停牌，构建组票组合需进行调整。因此构建的股票组合通常并不能和指数构成相吻合，从而形成一定的跟踪误差。
3、强行平仓风险
当我们考察期货市场时，建立股指期货头寸所产生的风险也不可忽视。由于期货交易的杠杆机制和强行平仓制度极有可能使套利者面临被强行平仓的风险。例如，套利者进行正向套利(买现货卖期货)后，指数向上收敛。此时，现货头寸盈利，期货头寸亏损。尽管总和为盈利，但是套利者的期货头寸处于不利地位。如果指数持续上涨，套利者需追加足额保证金，否则就有可能被强行平仓。
4、冲击成本风险
在构建股票现货的组合时，可能产生一定的冲击成本，即成交价高于(买入时)或低于(卖空时)计算套利时的股价，从而使指数产生一定偏差，影响套利收益。事实上，套利者往往会对冲击成本形成一定的预估，以拓宽无套利区间。