主要是来自市场的风险以及来自创业板自身的风险。首先，主板市场存在的上市公司经营风险、上市公司诚信风险、上市公司盲目投资风险、中介机构不尽职导致的公司质量风险、股票大幅波动风险、市场炒作风险等，创业板市场都会存在，其次是来自创业板自身的风险，由于创业板市场上上市公司规模相对小，多处于创业及成长期，发展相对不成熟，其较主板的风险相对较高。
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创业板的公司规模小、成立时间短、业绩的未知因素大，你想一个小公司，有一两年的好业绩就能上市，一两年的好业绩能代表什么，说不定过两年就倒闭了（这样的事例太多了）。就是有可能变得很好，也可能真的让你一无所有。主板还没有这么大的波动性。
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一旦公司不好，创业板就制定了更快捷、更严格的退市制度，不像主板那样搞些ST、三板之类，好像还让你吊起。一旦退市，就可能真是废纸一张。