在股票市场中，当人们完全套用市盈率指标去衡量股票价格的时候，会发现市场变得无法理喻：股票的市盈率相差悬殊，并没有向银行利率看齐；市盈率越高的股票，其市场表现越好。是市盈率指标没有实际应用意义吗？其实不然，这只是投资者没能正确把握对市盈率指标的理解和应用而已。
1.市盈率指标对市场具有整体性的指导意义
市场的资金永远向收益率高的地方流动，就股票市场的整体平均市盈率而言，基本上是与银行利率水平看齐的。在降息以前，我国股市平均市盈率达到35-40倍就显得偏高了，而经过7次降息后，股市平均市盈率上升至40倍，则被视为"恢复性"的上涨。
2.衡量市盈率指标要考虑股票市场的特性。
与银行储蓄相比，股票市场具有高风险、高收益的特征。股票投资的收益，除了股息收入外，还存在买卖价差产生的损益。股票定价适当高于银行存款标准，体现了风险与收益成正比的原则。
3.以动态眼光看待市盈率
市盈率指标计算以公司上一年的盈利水平为依据，其最大的缺陷在于忽略了对公司未来盈利状况的预测。从单个公司来看，市盈率指标对业绩较稳定的公用事业、商业类公司参考较大，但对业绩不稳定的公司，则易产生判断偏差。以上面提到的东大阿派为例，由于公司市场前景广阔，具有很高的成长性，受到投资者的追捧，股价上升，市盈率居高不下，但以公司每年80%的利润增长速度，以现价购入，一年后的市盈率已经大幅下降；相反，一些身处夕阳产业的上市公司，目前市盈率低到20倍左右，但公司经营状况不佳，利润呈滑坡趋势，以现价购入，一年后的市盈率可就奇高无比了。
市盈率高，在一定程度上反映了投资者对公司增长潜力的认同，不仅在中国股市如此，在欧美、香港成熟的投票市场上同样如此。从这个角度去看，投资者就不难理解为什么高科技板块的股票市盈率接近或超过100倍，而摩托车制造、钢铁行业的股票市盈率只有20倍了。当然，这并不是说股票的市盈率越高就越好，我国股市尚处于初级阶段，庄家肆意拉抬股价，造成市盈率奇高，市场风险巨大的现象时有发生，投资者应该从公司背景、基本素质等方面多加分析，对市盈率水平进行合理判断。