证券组合费是指香港结算根据中国结算名义持有账户每自然日日终港股持有市值，按逐级递减的费率标准，所计收的存管和公司行为服务费用（详见下表）。中国结算依据相同标准，对每个持有港股的A股证券账户进行收取。
　　持有港股的市值（币种：港币）
　　年费率
　　小于或等于港币500亿元
　　0.008%
　　大于港币500亿元，小于或等于2,500亿元
　　0.007%
　　大于港币2,500亿元，小于或等于5,000亿元
　　0.006%
　　大于港币5,000亿元，小于或等于7,500亿元
　　0.005%
　　大于港币7,500亿元，小于或等于10,000亿元
　　0.004%
　　大于港币10,000亿元
　　0.003%
　　提示投资者注意，由于证券组合费根据投资者证券账户持有市值以一定的比例按自然日进行计算收取，也就是说，如果持有港股通证券，即使不交易，也需每日缴纳证券组合费，投资者应避免因此发生资金透支。