你好，证券交易所基金和支付宝基金交易在费率方面确实存在差异。

在证券交易所交易的开放式基金认购和赎回费用由基金公司自行制定，一般包括管理费、托管费和销售服务费等，具体费率根据不同的基金公司和基金类型而定。2018年，我国证券交易所还出台了新的交易规则，取消了之前的交易佣金，实行了一定的减费政策。

而在支付宝基金交易中，基金管理公司会从基金净值中直接扣除管理费率，一般为基金资产净值的百分之几，不同基金类型和公司的比例也略有差异，但总体幅度较低。此外，支付宝基金交易也不收取交易佣金等其他费用，但需要注意的是，该平台存在货币基金转出提现需要缴纳的资金赎回费用。

总体来说，证券交易所基金和支付宝基金交易的费用各有特点，不同的基金类型和平台之间可能会存在较大差异。

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