机构户网下配售新股在上市首日买卖存在一定的限制。具体来说，对于大部分证券交易所而言，新股上市的首日受到了“绿鞋”机制的限制，即新股上市首日买卖存在一定的限制，这是为了保护市场的稳定和投资者的利益而采取的一种措施。

在此机制下，券商在向机构、散户等投资者进行大量网下配售时，通常会预留一定比例的新股作为“绿鞋”认股权，即发行人授予承销商在规定期限内购买由于上市首日股价下跌而产生的超额配售股份的权利。如果新股上市后价格表现不佳，导致股价下跌，这些承销商便可以利用“绿鞋”认股权回购股票，从而抵消超额认购权带来的损失，从而保护发行人和投资者的利益。

在“绿鞋”机制执行期间，承销商通过回购上市首日的新股来平抑市场波动，因此可能会出现机构户网下配售新股在上市首日买卖的限制。具体来说，在“绿鞋”机制执行期间，机构户和散户可能只能在一定的时间范围内进行交易，而不能自由买卖，直到“绿鞋”机制期满后才能恢复正常交易。