台湾的证券市场可以分为三个层次，台湾证券交易所、柜台中心、兴柜市场，分别类似于大陆的上海证券交易所、新三板和上海股权托管交易中心。

至2004年底,台湾证券交易所的投资者开户总数超过1400万户,上市的公司总数为697家,上市普通股及特别股总计704种,可转债5种,合计股数为5031亿股,市值13.99兆新台币。除了公司股票之外,还有存托凭证、受益凭证,认购权证、政府债券、公司债券等多个种类的证券上市交易。

柜台中心的交易模式以竞价制度为主、做市商制度为辅。截至2006年3月10日,柜台中心的投资者开户总数超过1000万户,股票已上柜公司家数为511家,此外还有公债、金融债、公司债等多种债券以及可转债、认股权证、衍生产品等交易品种。
兴柜市场属于新开发的股票市场,目的是取代以“盘商”为中介的未上市上柜股票的交易,将未上市上柜股票纳入制度化管理,为投资者提供一个合法、安全、透明的交易市场。所谓的“兴柜股票”,就是指已经申报上市或上柜辅导契约之公开发行公司的普通股股票,在还没有上市、上柜挂牌之前,经过柜台中心依据相关规定核准,先在证券商营业处所议价买卖的股票。

其中柜台中心的发展最早是类似于大陆地区的新三板，作为低于主板、中小板层次的一个证券交易场所，或者说，也类似于纳斯达克在美国资本市场的地位。后来的不断发展中，柜台中心的发展使得其具备了和台北证券交易所相媲美的地位。