1.转入流程上：经笔者体验，两款产品都流程简单，支付顺畅，5秒之内便可以完成申购。不过考虑到大家每天打开微信的频率远远高于支付宝钱包，因此理财通在随时随地转入以及随时查看收益方面，较余额宝更有吸引力。
2.转入额度上：微信理财通规定，试运行期间单卡单日不超过8000元，每个理财通账户资金不超过100万元。余额宝使用支付宝余额转入每日无限额，储蓄卡快捷支付单笔不超过5万，每日不超过5万(电脑端是不超过5000)，每月不超过10万，每个账户资金不超过100万元。
3.转出额度上：微信理财通每个账户每日转出金额不超过6000元，每日可转出3次;余额宝转出至银行卡单笔限额100万元，每日限额100万元，每日最多可转出3次，每月无限额。转出到支付宝账户每日限额5万，每月限额20万。
4.到账时间上：微信理财通支持工行、农行、建行等11家银行2小时到账，其他银行1-3天内到账。余额宝在手机端支持2小时到账，电脑端24小时到账。
5.收益率上：相差不多，理财通是6.44%，余额宝是6.67%，这个数字并不能说明什么，因为一直在变动，很可能几天后理财通就超过余额宝了，这个都说不好。
其实真的要比较微信理财通和余额宝哪个好的话还真的不能一较上下，但是它们之间有一个很重要的区别就是额宝可以直接用来消费、购物，理财通不可以，除非你先转出到银行卡。总之，理财通的可操作性要强些，而余额宝的可使用性要高于它。