结构性存款，顾名思义，其结构相较于传统存款更为复杂。它是在普通存款的基础上，融入了一些金融衍生工具，比如远期合约、掉期交易、期权或期货等。这样的设计使得结构性存款的收益不仅受到利率影响，还与汇率、股票价格、商品价格、信用状况以及市场指数等多种因素挂钩。因此，尽管本金安全得到了保障，但投资者需要承担一定的市场风险，以换取可能高于普通存款的收益。

而保本理财则主要强调的是本金的安全性。不论市场如何波动，投资者在理财产品到期时都能确保本金不受损失。这类产品通常分为两类：一类是保本且保证固定收益的，即投资者在到期时不仅能收回本金，还能获得一个固定的收益；另一类是保本但收益浮动的，虽然本金安全，但具体收益会根据市场情况有所变动。

从两者的关系来看，它们共同之处在于都提供了本金保障，但在风险和收益上有所不同。结构性存款由于涉及多种金融衍生工具，因此风险相对较高，但潜在的收益也可能更为可观。而保本理财则相对稳健，主要关注本金的安全和稳定的收益。