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不同周期的国债逆回购，费用率有所不同，其具体标准如下：
1、1天成交金额的0.001%(十万分之1)；
2、2天成交金额的0.002%；
3、3天成交金额的0.003%；
4、4天成交金额的0.004%；
5、7天成交金额的0.005%；
6、14天成交金额的 0.010%；
7、28天成交金额的0.020%；
8、28天以上成交金额的0.030%。
9、182天以上逆回购标的收取投资资金的0.03%手续费，就表示0.03%是封顶最高的手续费。
并且，上海交易所和深圳交易所的国债逆回购的佣金手续费用规定是相同的。

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