一、保障方式不同
前面概况中也说到了，企业年金的本质是职工和企业资金统筹、风险共担的基金投资运作模式，职工退休后能够领取到的企业年金个人账户资金的多少，只跟职工个人、单位缴纳的多少和基金投资运作的情况有关，所谓的“个人账户完全积累”的方式，实质就是个人理财专户，缴纳的多、投资收益好，退休后自然领取的也多，养老保障的效果和水平就高。商业养老保险的本质上就是针对退休后长寿风险所开发的商业保险产品，其保障的方式就是保险公司吸纳投保人缴纳的保费后，按照保险资金投资范围进行市场化运作，向个人投保人提供一个类似保底的预定利率，在此基础上，根据保险公司经营情况给予一定的分红，当职工按照保险合同约定缴纳完保费以后，定期领取养老保障资金至身故或者到特定的金额。

二、资产独立性不同
企业年金基金按照《企业年金基金管理办法》规定，其实质是信托财产，独立于委托人、受托人、账管人、托管人和投管人以及参与企业年金运作、服务的任何自然人与机构法人的固有财产及其管理的其他财产。企业年金基金不因企业、个人、管理机构的破产、重组等情况而受影响，具有信托财产一样的独立性。

商业养老保险则完全不同，实质就是保险产品，保险公司募集了企业和个人所缴纳的保险费后，与保险公司的资产一起管理，俗话说“入表”，形成保险公司的资产与负责，与保险公司的经营情况密切相关，不具备财产独立性。

三、投资运作的透明性不同
其实，这一点原因就在于企业年金基金与商业养老保险保费的财产独立性不同。

企业年金基金由于具有高度的财产独立性，在投资运作的过程中，通过受托人、账管人、托管人和投管人四种管理机构的相关制约和配合，形成了“资金流”和“信息流”的有效分离，受托人是基金财产的主责任人，可以支配企业年金基金财产，但是受托人不直接保管基金财产，而是引入托管人来进行监督管理。同时，账管人负责企业年金的账务信息流处理，也不负责资金的保管。投资管理人仅负责对分配的基金资产进行投资运作，并接受受托人和托管人的监督。

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