同花顺开户和证券公司自己的APP开户是有区别的，主要体现在以下几个方面：

开户主体不同。同花顺是一款第三方金融信息服务软件，它并不属于券商，也没有证券业务牌照，只是和多家券商合作提供开户和交易功能。证券公司自己的APP则是直接由券商推出的，有证监会的监管和保护，资金账户实现了银行存管。

佣金费率不同。同花顺为了不打佣金战，统一了所有的开户佣金，。而证券公司自己的APP开户，佣金费率可能会更低，如果您想节省交易成本，建议您选择证券公司自己的开户，可以直接找券商的客户经理。

服务性不同。同花顺上开户后一般没有对应的客户经理服务，有问题需要自己打官方电话咨询。证券公司自己的APP则相对比较安全，有专业的客户经理为您提供服务和指导。

功能体验不同。同花顺在功能上比较强大，提供了丰富的行情数据、资讯、分析工具等。当然现在很多的券商在软件开发上面也是非常不错的。如果您想获得更好的看盘和分析体验，建议您使用同花顺。

以上就是同花顺和证券公司APP开户的一些区别，如果有证券开户相关的需要，欢迎在线联系咨询办理。